CILJ KOLEGIJA:  
Osnovni je cilj kolegija upoznati studente s temeljnim načelima suvremene organske kemije, razumijevanjem odnosa strukture i djelovanja organskih spojeva i primjenom metoda sinteze organskih spojeva u bioznanostima i industriji. 
 
IZVEDBENI PROGRAM KOLEGIJA:  
1. UGLJIKOVI SPOJEVI I UVOD U STRUKTURNU TEORIJU ORGANSKE KEMIJE: uvod u strukturnu teoriju: empirijske i strukturne molekulske formule, izomeri, tetraedarska struktura metana;  kemijske veze-pravilo okteta, ionski i kovalentni spojevi, Lewisove strukture, rezonancija; kvantna mehanika (Schrödingerova valna jednadžba), atomske i molekulske orbitale; struktura metana i etana: sp3-hibiridizacija; struktura etena: sp2-hibiridizacija, cis-trans izomerija; struktura etina: sp-hibridizacija. 
Primjeri zadataka za određivanje struktura izomera, kovalentnih i ionskih veza u molekuli, Lewisovih struktura, rezonancijskih struktura. 
2. UVOD U ORGANSKE REAKCIJE: KISELINE I BAZE: Vrste kemijskih reakcija i njihovi memanizmi;  kiselo-bazne reakcije, Brönstedova, Lowryeva i Lewisova definicija kiselina i baza; heteroliza ugljikovih veza (karbokationi i karbanioni), jakost kiselina i baza, odnos strukture i djelovanja kiselina, kiselost karboksilnih kiselina, organski spojevi kao baze; uvod u mehanizme organskih reakcija.  
Primjeri zadataka kiselo-baznih reakcija, prepoznavanja kiselina i baza u reakcijama i kiselosti zadanih spojeva. 
3. RAZREDI UGLJIKOVIH SPOJEVA, FUNKCIONALNE SKUPINE: Ugljikovodici: alkani, alkeni, alkini i aromatski spojevi; polarne kovalentne veze, polarne i nepolarne molekule, funkcionalne skupine u organskim molekulama, alkil-halogenidi, alkoholi, eteri, amini, aldehidi i ketoni, karboksilne kiseline, esteri i amidi, nitrili. Odnos strukture  i fizikalnih svojstava molekula (vodikove veze, van der Waalsove sile). 
Primjeri zadataka za definiranje funkcionalnih skupina i pripadajućih razreda spojeva, imenovanje predstavnika razreda ugljikovih spojeva. 
4. ALKANI - KONFORMACIJSKA ANALIZA I UVOD  U SINTEZU: Konformacijska analiza alkana, relativna stabilnost cikloalkana-napetost prstenova, cis- i trans-izomerija cikloalkana, sinteza alkana i cikloalkana, planiranje organske sinteze- retrosintetska analiza (sintoni, strategija interkonverzije funkcionalnih skupina, stereokemijske i topološke strategije), primjeri sinteza biološki i farmakološki značajnih molekula na osnovu retrosintetske analize. 
Primjeri zadataka za određivanje konformacije pojedinih alkana, cis- i trans-izomerije cikloalkana. 
5. STEREOKEMIJA I KIRALNOST I: biološki značaj kiralnosti; izomerija: konstitucijski izomeri i stereoizomeri; kiralne molekule i enantiomeri, nomenklatura enantiomera (Cahn-Ingold-Prelogov sustav pravila R, S), relativna i apsolutna konfiguracija, optička aktivnost enantiomera, molekule s više središta kiralnosti, meso-spojevi, Fischerove projekcijske formule, stereoizomerija cikličkih spojeva. 
Primjeri zadataka za određivanje relativne i apsolutne konfiguracije spojeva s jednim središtem kiralnosti. 
6. STEREOKEMIJA I KIRALNOST II: Heteroatomi kao središta kiralnosti, aksijalna kiralnost (atropizomerija), heličnost (uzvojitost), homokiralnost u prirodi, pseudokiralnost, prokiralnost, dijastereoizomerija, priprava enantiomerno čistih spojeva (frakcijska kristalizacija racemata, kromatografsko odvajanje enantiomera na kiralnim stacionarnim fazama), kiralni lijekovi-međudjelovanje enantiomera lijeka i receptora. 
Primjeri zadataka za određivanje relativne i apsolutne konfiguracije spojeva s više središta kiralnosti. 
7. IONSKE REAKCIJE - NUKLEOFILNE SUPSTITUCIJSKE REAKCIJE ALKIL-HALOGENIDA : Nukleofilne supstitucijske reakcije: nukeofili, izlazne skupine; kinetika, mehanizam i stereokemija SN2 i SN1 reakcija (karbokationi); primjeri organskih sinteza transformacijom  funkcionalnih skupina s pomoću reakcija SN2. 
Primjeri zadataka za nukleofilne supstitucijske reakcije alkil-halogenida. 
8. IONSKE REAKCIJE - ELIMINACIJSKE REAKCIJE ALKIL-HALOGENIDA: utjecaj nukleofila na kompetitivne reakciju eliminacije i supstitucije; mehanizam reakcija E1 i E2, stereoselektivnost i regioselektivnost reakcija E1, stereospecifičnost E2 reakcija supstituiranih cikloheksana, regioselektvnost u eliminacijskim reakcijama (Hoffmannovo i Zajcevljevo pravilo), karbanionski mehanizam reakcija eliminacije (E1cB). 
Primjeri zadataka za eliminacijske reakcije alkil-halogenida. 
9. ALKENI I ALKINI I: SVOJSTVA I SINTEZA: određivanje konfiguracije E- i Z-dijastereoizomera, relativna stabilnost alkena, cikloalkeni, sinteza alkena dehidrohalogeniranjem alkil-halogenida i dehidratacijom alkohola, stabilnost karbokationa i molekularna pregrađivanja, sinteza alkina eliminacijskim reakcijama, kiselost terminalnih alkina i zamjena kiselih vodikovih atoma terminalnih alkina.  
Primjeri zadataka u sintezi alkena i alkina i određivanja E- i Z-konfiguracije. 
10. ALKENI I ALKINI II: ADICIJSKE REAKCIJE: adicija halogenovodika na alkene (Markovnikovljevo pravilo), stereokemija ionskih reakcija adicije na alkene, oksimerkuriranje i demerkuriranje alkena (Markovnikovljeva adicija) sinteza alkohola hidroboriranjem i oksidacijom alkena (sin-hidratacija, anti-Markovnikovljevo pravilo), hidroboriranje alkena i sinteza alkil-borana, adicija halogena na alkene, stereokemija reakcija adicije halogena na alkene. 
Primjeri zadataka za adicijske reakcije. 
11. ODREĐIVANJE STRUKTURA ORGANSKIH SPOJEVA NUKLEARNOM MAGNETSKOM REZONANCIJOM I SPEKTROMETRIJOM MASA: uvod u spektroskopiju nuklearne magnetske rezonancije (NMR), spin jezgre, zasjenjenje i odsjenjenje protona, kemijski pomak, kemijski ekvivalentni i neekvivalentni protoni, cijepanje signala: spin-spin sprege, 1H i 13C jedno- i  dvodimenzijska spektroskopija nuklearne magnetske rezonancije (1D i 2D-NMR), primjena nuklearne magnetske rezonancije u medicini; uvod u spektrometriju masa, ionizacija i fragmentacija molekularnog iona, određivanje molekularne formule i mase, primjena spektrometrije masa u biomedicini. 
Primjeri zadataka u određivanju struktura pomoću spektara 1H NMR i masenih spektara spojeva. 
12. RADIKALSKE REAKCIJE: energije homolitičkog cijepanja veze i relativna stabilnost radikala, selektivnost u radikalskim supstitucijskim reakcijama, kloriranje metana-energija aktivacije, halogeniranje viših alkana, geometrija alkil-radikala, radikalske adicije na alkene (anti-Markovnikovljeva adicija halogenovodika), radikalske polimerizacije alkena, radikali u biologiji, medicini i industriji. 
Primjeri zadataka za radikalske reakcije. 
13. ALKOHOLI: sinteza alkohola iz alkena, reakcije alkohola, alkoholi kao kiseline, pretvorba alkohola u alkil-halogenide, mehanizam reakcije alkohola i halogenovodične kisleine derivati alkohola s izlaznim skupinama: tosilati, mesilati i triflati, reakcije alkohola s aldehidima i ketonima-stvaranje poluacetala i acetala, sililni eteri-zaštitne skupine alkohola, šećerni alkoholi. 
Primjeri zadataka za sintezu i reakcije alkohola. 
14. ETERI: sinteza etera, sililne zaštitne skupine u eterima, reakcije etera (cijepanje etera jakim kiselinama), ciklički eteri (epoksidi): sinteza epoksidacijom alkena, Sharplessova asimetrična epoksidacija alkena; reakcije epoksida (kiselo katalizirano otvaranje prstena, karcinogenost epoksida biološkom oksidacijom, kruna-eteri: međufazni katalizatori, transport antibiotika i kruna-eteri.  
Primjeri zadataka za sintezu i reakcije etera. 
 
RAZVIJANJE OPĆIH I SPECIFIČNIH KOMPETENCIJA STUDENATA 
Osnovni je cilj edukacije studenata ovladati načelima organske kemije i metodama organske sinteze, i njihovom primjenom u sintezi novih spojeva. 
Specifične kompetencije: savladavanje osnovnih tehnika rada u sintezi organskih spojeva i njihovoj identifikaciji. 
 
OBAVEZE STUDENATA U NASTAVI I NAČINI NJIHOVA IZVRŠAVANJA  
Obavezno je sudjelovanje na predavanjima i vježbama. Provodit će se kontinuirana provjera znanja testovima tijekom predavanja o čijem će rezultatu ovisiti i oslobađanje od pismenog dijela ispita.  
 
UVJETI ZA DOBIVANJE POTPISA  
Uredno pohađanje nastave 
 
NAČIN IZVOĐENJA NASTAVE:  
Predavanja i vježbe 
 
NAČIN PROVJERE ZNANJA I POLAGANJA ISPITA 
Tri testa tijekom semestra, pismeni i usmeni ispit. 
 
NAČIN PRAĆENJA KVALITETE I USPJEŠNOSTI KOLEGIJA 
Studentska anketa 
 
KOJE KOLEGIJE STUDENTI MORAJU POLOŽITI DA BI MOGLI PRATITI GORE NAVEDENE NASTAVNE SADRŽAJE 
Opća i anorganska kemija, analitička kemija 
 
ISHODI UČENJA KOLEGIJA: 
1. analizirati građu spojeva s ugljikom, definirati organske spojeve i prirodu kemijske veze u organskim molekulama na osnovu teorije molekulskih orbitala i hibridnih atomskih orbitala 
2. definirati osnovne vrste organskih reakcija i objasniti osnovne reakcijske mehanizme uz prepoznavanje reaktivnih međuprodukata reakcija,  
3. označiti funkcionalne skupine u molekulama i definirati klase spojeva, primijeniti IUPAC-ova pravila za imenovanje organskih spojeva 
4. objasniti konformacije alkana i cikloalkana, definirati i imenovati izomere 
7. definirati osnovne reakcije sinteze i reakcije u kojima sudjeluju alkani, alkeni, alkini, alkoholi, eteri, objasniti radikalske reakcije 
 
ISHODI UČENJA NA RAZINI PROGRAMA: 
1. rješavati kvalitativne kvantitativne probleme primjenom prikladnih kemijskih principa i teorija 
2. prezentirati materijale vezane uz studij (usmeno i pismeno) stručnom auditoriju 
3. primijeniti znanja u praksi, posebno u rješavanju problema na temelju kvalitativnih ili kvantitativnih informacija 
4. primijeniti standardne laboratorijske postupke i instrumentaciju u preparativne ili analitičke svrhe, za organske i anorganske sustave 
5. procijeniti rizike vezane uz uporabu određenih kemijskih tvari ili laboratorijskih postupaka 
6. pokazati sposobnost uključivanja u interdisciplinarni timski rad 
 
NASTAVNE JEDINICE S PRIPADAJUĆIM ISHODIMA UČENJA I KRITERIJIMA VREDNOVANJA: 
Nastavna jedinica: 
1. Ugljikovi spojevi i kemijske veza, strukurna teorija, atomske i molekulske orbitale - hibridizacija 
Ishodi učenja: 
- analizirati građu spojeva s ugljikom, vezivanje u organskim molekulama i strukture molekula u prostoru 
- definirati rezonancijske stukture 
- upoznati se s pojmom hibridizacije ugljikova atoma: sp3, sp2 i sp hibridizacija i vrsti veze između ugljikovih atoma 
Kriteriji vrednovanja: 
- nacrtati spojeve s ionskim i kovalentnim vezama, identificirati kut veze 
- odrediti naboj molekule 
- crtati Lewisove strukture zadanih spojeva 
- nacrtati rezonancijske strukture 
 
Nastavna jedinica: 
2. Uvod u organske reakcije, kiselo-bazne reakcije, definicije kiselina i baza; heteroliza ugljikovih veza (karbokationi i karbanioni), uvod u mehanizme organskih reakcija 
Ishodi učenja: 
- definirati kiseline i baze, jakost kiselina i baza, odnos strukture i djelovanja kiselina 
- prepoznati heterolitičko cijepanje veze i nastajanje odgovarajućih intermedijara u takvim reakcijama 
Kriteriji vrednovanja: 
- prepoznati organske spojeve kao kiseline i baze 
- primijeniti teoriju kiselina i baza na konkretne organske spojeve 
- razlikovati homolitičko i heterolitičko cijepanje veze i primijeniti takvo cijepanje na konkretnim primjerima 
 
Nastavna jedinica: 
3. Klase spojeva - funkcionalne skupine 
Ishodi učenja: 
- prepoznati funkcionalne skupine u molekulama i definirati klase spojeva  
- primijeniti IUPAC-ova pravila za imenovanje organskih spojeva 
Kriteriji vrednovanja: 
- nacrtati strukturne formule organskih spojeva prema sustavnom imenu spoja i obrnuto  
- na osnovu strukture prepoznati fizikalna svojstava molekula 
 
Nastavna jedinica: 
4. Alkani i cikloalkani 
Ishodi učenja: 
- objasniti konformacije alkana i cikloalkana 
- definirati energetske promjene i stabilnost alkana 
- razumijevanje relativne stabilnosti cikloalkana 
Kriteriji vrednovanja: 
- nacrtati konformacije alkana i cikloalkana 
- odrediti enegetski povoljnije konformere 
- crtati konformacijske izomere klinastom projekcijskom formulom,  Newmanovom formulom 
 
Nastavna jedinica: 
5. Stereokemija i kiralnost 
Ishodi učenja: 
- definirati i imenovati konstitucijske izomere i stereoizomere 
- razumijevanje biološkog značaja kiralnosti 
- definirati relativnu i apsolutnu konfiguraciju (pravilo CIP) 
- poznavati stereoizomere cikličkih spojeva 
Kriteriji vrednovanja: 
- ilustrirati primjerima izomere 
- prepoznati kiralne molekule, odrediti stereogene centre i apsolutne konfiguracije molekula primjenom pravila CIP, meso-spojeve 
- nacrtati stereoizomere s jednim ili više stereogenih centara Fischerovom projekcijskom formulom 
 
Nastavna jedinica: 
6. Ionske reakcije 
Ishodi učenja: 
- razlikovati reakcije nukleofilne supstitucije s obzirom na kinetiku, mehanizam i stereokemiju reakcije 
- definirati kada su navedene reakcije odvijaju u kompeticiji s reakcijama eliminacije 
Kriteriji vrednovanja: 
- nacrtati strukture produkata u reakcijama supstitucije i eliminacije  
- ilustrirati primjerom čimbenike koji utječu na reakcije supstitucije (SN1 i SN2) i eliminacije (E1 i E2) 
 
Nastavna jedinica: 
7. Alkeni i alkini 
Ishodi učenja: 
- objasniti strukturu alkena i alkina i navesti osnovne reakcije dobivanja iz alkil- halogenida ili alkohola 
- razumijevanje reakcijskih mehanizama i prepoznavanje reaktivnih međuprodukata reakcija 
- objasniti reakciju elektrofilne adicije u odnosu na strukturu 
Kriteriji vrednovanja: 
- razlikovati nukleofile, elektrofile i slobodne radikale, razlikovati reakcije nukleofilne supstitucije, eliminacije (Zaitsevljevo i Hofmannovo pravilo), adicije (Markovnikovljevo pravilo) i primijeniti navedene reakcije na konkretnim primjerima 
- nacrtati strukturne formule produkata u reakcijama alikil-halogenida, alkohola i alkena uz definiranje stereokemije reakcija 
 
Nastavna jedinica: 
8. Nuklearna magnetska rezonancija (NMR) i spektrometrija masa 
Ishodi učenja: 
- objasniti princip nuklearne magnetske rezonancije (NMR) 
- definirati osnovne pojmove (kemijski pomak, cijepanje signala, integriranje signala, zasjenjenost protona) u NMR spektroskopiji 
- objasniti princip spektrometrije masa 
- definirati metode ionizacije organskih spojeva  
Kriteriji vrednovanja: 
- nacrtati strukturu organskog spoja prema zadanom 1H NMR spektru, 
- asignirati protone u 1H NMR spektru zadanog spoja  
- navesti fragmentiranje signala u masenom spektru za zadane spojeve 
 
Nastavna jedinica: 
9. Radikalske reakcije 
Ishodi učenja: 
- definirati radikalske reakcije i relativnu stabilnost nastalih radikala 
- objasniti višestruku supstituciju u odnosu na selektivne radikalske reakcije 
- objasniti selektivnost u radikalskim supstitucijskim reakcijama 
- definirati radikalsku polimerizaciju 
Kriteriji vrednovanja: 
- navesti primjere radikalskih reakcija uz objašnjenje mehanizma tih reakcija 
- razlikovati stabilnost strukturno različitih radikala  
- ilustrirati primjerom stereokemiju radikalskih reakcija 
- ilustrirati primjerom radikalsku polimerizaciju 
 
Nastavna jedinica: 
10. Alkoholi i eteri 
Ishodi učenja: 
- objasniti fizikalna svojstva alkohola i etera 
- poznavanje sinteze alkohola iz alkena i karbonilnih spojeva 
- poznavanje najvažnijih reakcija dobivanja etera 
- razumijevanje strategije primjene zaštitnih skupina  
- poznavanje reakcija alkohola i eter 
Kriteriji vrednovanja: 
- ilustrirati primjerima sinteze alkohola iz alkena, oksido-redukcijskom reakcijom, primjenom organometalnih spojeva 
 - primijeniti odgovarajuće reagense u sintezi alkohola i etera i njihovim reakcijama 
- primijeniti odgovarajuće zaštitne skupine alkohola 
- navesti metode dobivanja etera (Williamsonovom sintezom  i dr.)  
- navesti reakcije cijepanja etera, otvaranja epoksidnog prstena uz definiranje mehanizma i stereokemije reakcije 
                                 |