| CILJ KOLEGIJA: Osnovni je cilj kolegija upoznati studente s temeljnim načelima suvremene organske kemije, razumijevanjem odnosa strukture i djelovanja organskih spojeva i primjenom metoda sinteze organskih spojeva u bioznanostima i industriji.
 
 IZVEDBENI PROGRAM KOLEGIJA:
 1. UGLJIKOVI SPOJEVI I UVOD U STRUKTURNU TEORIJU ORGANSKE KEMIJE: uvod u strukturnu teoriju: empirijske i strukturne molekulske formule, izomeri, tetraedarska struktura metana;  kemijske veze-pravilo okteta, ionski i kovalentni spojevi, Lewisove strukture, rezonancija; kvantna mehanika (Schrödingerova valna jednadžba), atomske i molekulske orbitale; struktura metana i etana: sp3-hibiridizacija; struktura etena: sp2-hibiridizacija, cis-trans izomerija; struktura etina: sp-hibridizacija.
 Primjeri zadataka za određivanje struktura izomera, kovalentnih i ionskih veza u molekuli, Lewisovih struktura, rezonancijskih struktura.
 2. UVOD U ORGANSKE REAKCIJE: KISELINE I BAZE: Vrste kemijskih reakcija i njihovi memanizmi;  kiselo-bazne reakcije, Brönstedova, Lowryeva i Lewisova definicija kiselina i baza; heteroliza ugljikovih veza (karbokationi i karbanioni), jakost kiselina i baza, odnos strukture i djelovanja kiselina, kiselost karboksilnih kiselina, organski spojevi kao baze; uvod u mehanizme organskih reakcija.
 Primjeri zadataka kiselo-baznih reakcija, prepoznavanja kiselina i baza u reakcijama i kiselosti zadanih spojeva.
 3. RAZREDI UGLJIKOVIH SPOJEVA, FUNKCIONALNE SKUPINE: Ugljikovodici: alkani, alkeni, alkini i aromatski spojevi; polarne kovalentne veze, polarne i nepolarne molekule, funkcionalne skupine u organskim molekulama, alkil-halogenidi, alkoholi, eteri, amini, aldehidi i ketoni, karboksilne kiseline, esteri i amidi, nitrili. Odnos strukture  i fizikalnih svojstava molekula (vodikove veze, van der Waalsove sile).
 Primjeri zadataka za definiranje funkcionalnih skupina i pripadajućih razreda spojeva, imenovanje predstavnika razreda ugljikovih spojeva.
 4. ALKANI - KONFORMACIJSKA ANALIZA I UVOD  U SINTEZU: Konformacijska analiza alkana, relativna stabilnost cikloalkana-napetost prstenova, cis- i trans-izomerija cikloalkana, sinteza alkana i cikloalkana, planiranje organske sinteze- retrosintetska analiza (sintoni, strategija interkonverzije funkcionalnih skupina, stereokemijske i topološke strategije), primjeri sinteza biološki i farmakološki značajnih molekula na osnovu retrosintetske analize.
 Primjeri zadataka za određivanje konformacije pojedinih alkana, cis- i trans-izomerije cikloalkana.
 5. STEREOKEMIJA I KIRALNOST I: biološki značaj kiralnosti; izomerija: konstitucijski izomeri i stereoizomeri; kiralne molekule i enantiomeri, nomenklatura enantiomera (Cahn-Ingold-Prelogov sustav pravila R, S), relativna i apsolutna konfiguracija, optička aktivnost enantiomera, molekule s više središta kiralnosti, meso-spojevi, Fischerove projekcijske formule, stereoizomerija cikličkih spojeva.
 Primjeri zadataka za određivanje relativne i apsolutne konfiguracije spojeva s jednim središtem kiralnosti.
 6. STEREOKEMIJA I KIRALNOST II: Heteroatomi kao središta kiralnosti, aksijalna kiralnost (atropizomerija), heličnost (uzvojitost), homokiralnost u prirodi, pseudokiralnost, prokiralnost, dijastereoizomerija, priprava enantiomerno čistih spojeva (frakcijska kristalizacija racemata, kromatografsko odvajanje enantiomera na kiralnim stacionarnim fazama), kiralni lijekovi-međudjelovanje enantiomera lijeka i receptora.
 Primjeri zadataka za određivanje relativne i apsolutne konfiguracije spojeva s više središta kiralnosti.
 7. IONSKE REAKCIJE - NUKLEOFILNE SUPSTITUCIJSKE REAKCIJE ALKIL-HALOGENIDA : Nukleofilne supstitucijske reakcije: nukeofili, izlazne skupine; kinetika, mehanizam i stereokemija SN2 i SN1 reakcija (karbokationi); primjeri organskih sinteza transformacijom  funkcionalnih skupina s pomoću reakcija SN2.
 Primjeri zadataka za nukleofilne supstitucijske reakcije alkil-halogenida.
 8. IONSKE REAKCIJE - ELIMINACIJSKE REAKCIJE ALKIL-HALOGENIDA: utjecaj nukleofila na kompetitivne reakciju eliminacije i supstitucije; mehanizam reakcija E1 i E2, stereoselektivnost i regioselektivnost reakcija E1, stereospecifičnost E2 reakcija supstituiranih cikloheksana, regioselektvnost u eliminacijskim reakcijama (Hoffmannovo i Zajcevljevo pravilo), karbanionski mehanizam reakcija eliminacije (E1cB).
 Primjeri zadataka za eliminacijske reakcije alkil-halogenida.
 9. ALKENI I ALKINI I: SVOJSTVA I SINTEZA: određivanje konfiguracije E- i Z-dijastereoizomera, relativna stabilnost alkena, cikloalkeni, sinteza alkena dehidrohalogeniranjem alkil-halogenida i dehidratacijom alkohola, stabilnost karbokationa i molekularna pregrađivanja, sinteza alkina eliminacijskim reakcijama, kiselost terminalnih alkina i zamjena kiselih vodikovih atoma terminalnih alkina.
 Primjeri zadataka u sintezi alkena i alkina i određivanja E- i Z-konfiguracije.
 10. ALKENI I ALKINI II: ADICIJSKE REAKCIJE: adicija halogenovodika na alkene (Markovnikovljevo pravilo), stereokemija ionskih reakcija adicije na alkene, oksimerkuriranje i demerkuriranje alkena (Markovnikovljeva adicija) sinteza alkohola hidroboriranjem i oksidacijom alkena (sin-hidratacija, anti-Markovnikovljevo pravilo), hidroboriranje alkena i sinteza alkil-borana, adicija halogena na alkene, stereokemija reakcija adicije halogena na alkene.
 Primjeri zadataka za adicijske reakcije.
 11. ODREĐIVANJE STRUKTURA ORGANSKIH SPOJEVA NUKLEARNOM MAGNETSKOM REZONANCIJOM I SPEKTROMETRIJOM MASA: uvod u spektroskopiju nuklearne magnetske rezonancije (NMR), spin jezgre, zasjenjenje i odsjenjenje protona, kemijski pomak, kemijski ekvivalentni i neekvivalentni protoni, cijepanje signala: spin-spin sprege, 1H i 13C jedno- i  dvodimenzijska spektroskopija nuklearne magnetske rezonancije (1D i 2D-NMR), primjena nuklearne magnetske rezonancije u medicini; uvod u spektrometriju masa, ionizacija i fragmentacija molekularnog iona, određivanje molekularne formule i mase, primjena spektrometrije masa u biomedicini.
 Primjeri zadataka u određivanju struktura pomoću spektara 1H NMR i masenih spektara spojeva.
 12. RADIKALSKE REAKCIJE: energije homolitičkog cijepanja veze i relativna stabilnost radikala, selektivnost u radikalskim supstitucijskim reakcijama, kloriranje metana-energija aktivacije, halogeniranje viših alkana, geometrija alkil-radikala, radikalske adicije na alkene (anti-Markovnikovljeva adicija halogenovodika), radikalske polimerizacije alkena, radikali u biologiji, medicini i industriji.
 Primjeri zadataka za radikalske reakcije.
 13. ALKOHOLI: sinteza alkohola iz alkena, reakcije alkohola, alkoholi kao kiseline, pretvorba alkohola u alkil-halogenide, mehanizam reakcije alkohola i halogenovodične kisleine derivati alkohola s izlaznim skupinama: tosilati, mesilati i triflati, reakcije alkohola s aldehidima i ketonima-stvaranje poluacetala i acetala, sililni eteri-zaštitne skupine alkohola, šećerni alkoholi.
 Primjeri zadataka za sintezu i reakcije alkohola.
 14. ETERI: sinteza etera, sililne zaštitne skupine u eterima, reakcije etera (cijepanje etera jakim kiselinama), ciklički eteri (epoksidi): sinteza epoksidacijom alkena, Sharplessova asimetrična epoksidacija alkena; reakcije epoksida (kiselo katalizirano otvaranje prstena, karcinogenost epoksida biološkom oksidacijom, kruna-eteri: međufazni katalizatori, transport antibiotika i kruna-eteri.
 Primjeri zadataka za sintezu i reakcije etera.
 
 RAZVIJANJE OPĆIH I SPECIFIČNIH KOMPETENCIJA STUDENATA
 Osnovni je cilj edukacije studenata ovladati načelima organske kemije i metodama organske sinteze, i njihovom primjenom u sintezi novih spojeva.
 Specifične kompetencije: savladavanje osnovnih tehnika rada u sintezi organskih spojeva i njihovoj identifikaciji.
 
 OBAVEZE STUDENATA U NASTAVI I NAČINI NJIHOVA IZVRŠAVANJA
 Obavezno je sudjelovanje na predavanjima i vježbama. Provodit će se kontinuirana provjera znanja testovima tijekom predavanja o čijem će rezultatu ovisiti i oslobađanje od pismenog dijela ispita.
 
 UVJETI ZA DOBIVANJE POTPISA
 Uredno pohađanje nastave
 
 NAČIN IZVOĐENJA NASTAVE:
 Predavanja i vježbe
 
 NAČIN PROVJERE ZNANJA I POLAGANJA ISPITA
 Tri testa tijekom semestra, pismeni i usmeni ispit.
 
 NAČIN PRAĆENJA KVALITETE I USPJEŠNOSTI KOLEGIJA
 Studentska anketa
 
 KOJE KOLEGIJE STUDENTI MORAJU POLOŽITI DA BI MOGLI PRATITI GORE NAVEDENE NASTAVNE SADRŽAJE
 Opća i anorganska kemija, analitička kemija
 
 ISHODI UČENJA KOLEGIJA:
 1. analizirati građu spojeva s ugljikom, definirati organske spojeve i prirodu kemijske veze u organskim molekulama na osnovu teorije molekulskih orbitala i hibridnih atomskih orbitala
 2. definirati osnovne vrste organskih reakcija i objasniti osnovne reakcijske mehanizme uz prepoznavanje reaktivnih međuprodukata reakcija,
 3. označiti funkcionalne skupine u molekulama i definirati klase spojeva, primijeniti IUPAC-ova pravila za imenovanje organskih spojeva
 4. objasniti konformacije alkana i cikloalkana, definirati i imenovati izomere
 7. definirati osnovne reakcije sinteze i reakcije u kojima sudjeluju alkani, alkeni, alkini, alkoholi, eteri, objasniti radikalske reakcije
 
 ISHODI UČENJA NA RAZINI PROGRAMA:
 1. rješavati kvalitativne kvantitativne probleme primjenom prikladnih kemijskih principa i teorija
 2. prezentirati materijale vezane uz studij (usmeno i pismeno) stručnom auditoriju
 3. primijeniti znanja u praksi, posebno u rješavanju problema na temelju kvalitativnih ili kvantitativnih informacija
 4. primijeniti standardne laboratorijske postupke i instrumentaciju u preparativne ili analitičke svrhe, za organske i anorganske sustave
 5. procijeniti rizike vezane uz uporabu određenih kemijskih tvari ili laboratorijskih postupaka
 6. pokazati sposobnost uključivanja u interdisciplinarni timski rad
 
 NASTAVNE JEDINICE S PRIPADAJUĆIM ISHODIMA UČENJA I KRITERIJIMA VREDNOVANJA:
 Nastavna jedinica:
 1. Ugljikovi spojevi i kemijske veza, strukurna teorija, atomske i molekulske orbitale - hibridizacija
 Ishodi učenja:
 - analizirati građu spojeva s ugljikom, vezivanje u organskim molekulama i strukture molekula u prostoru
 - definirati rezonancijske stukture
 - upoznati se s pojmom hibridizacije ugljikova atoma: sp3, sp2 i sp hibridizacija i vrsti veze između ugljikovih atoma
 Kriteriji vrednovanja:
 - nacrtati spojeve s ionskim i kovalentnim vezama, identificirati kut veze
 - odrediti naboj molekule
 - crtati Lewisove strukture zadanih spojeva
 - nacrtati rezonancijske strukture
 
 Nastavna jedinica:
 2. Uvod u organske reakcije, kiselo-bazne reakcije, definicije kiselina i baza; heteroliza ugljikovih veza (karbokationi i karbanioni), uvod u mehanizme organskih reakcija
 Ishodi učenja:
 - definirati kiseline i baze, jakost kiselina i baza, odnos strukture i djelovanja kiselina
 - prepoznati heterolitičko cijepanje veze i nastajanje odgovarajućih intermedijara u takvim reakcijama
 Kriteriji vrednovanja:
 - prepoznati organske spojeve kao kiseline i baze
 - primijeniti teoriju kiselina i baza na konkretne organske spojeve
 - razlikovati homolitičko i heterolitičko cijepanje veze i primijeniti takvo cijepanje na konkretnim primjerima
 
 Nastavna jedinica:
 3. Klase spojeva - funkcionalne skupine
 Ishodi učenja:
 - prepoznati funkcionalne skupine u molekulama i definirati klase spojeva
 - primijeniti IUPAC-ova pravila za imenovanje organskih spojeva
 Kriteriji vrednovanja:
 - nacrtati strukturne formule organskih spojeva prema sustavnom imenu spoja i obrnuto
 - na osnovu strukture prepoznati fizikalna svojstava molekula
 
 Nastavna jedinica:
 4. Alkani i cikloalkani
 Ishodi učenja:
 - objasniti konformacije alkana i cikloalkana
 - definirati energetske promjene i stabilnost alkana
 - razumijevanje relativne stabilnosti cikloalkana
 Kriteriji vrednovanja:
 - nacrtati konformacije alkana i cikloalkana
 - odrediti enegetski povoljnije konformere
 - crtati konformacijske izomere klinastom projekcijskom formulom,  Newmanovom formulom
 
 Nastavna jedinica:
 5. Stereokemija i kiralnost
 Ishodi učenja:
 - definirati i imenovati konstitucijske izomere i stereoizomere
 - razumijevanje biološkog značaja kiralnosti
 - definirati relativnu i apsolutnu konfiguraciju (pravilo CIP)
 - poznavati stereoizomere cikličkih spojeva
 Kriteriji vrednovanja:
 - ilustrirati primjerima izomere
 - prepoznati kiralne molekule, odrediti stereogene centre i apsolutne konfiguracije molekula primjenom pravila CIP, meso-spojeve
 - nacrtati stereoizomere s jednim ili više stereogenih centara Fischerovom projekcijskom formulom
 
 Nastavna jedinica:
 6. Ionske reakcije
 Ishodi učenja:
 - razlikovati reakcije nukleofilne supstitucije s obzirom na kinetiku, mehanizam i stereokemiju reakcije
 - definirati kada su navedene reakcije odvijaju u kompeticiji s reakcijama eliminacije
 Kriteriji vrednovanja:
 - nacrtati strukture produkata u reakcijama supstitucije i eliminacije
 - ilustrirati primjerom čimbenike koji utječu na reakcije supstitucije (SN1 i SN2) i eliminacije (E1 i E2)
 
 Nastavna jedinica:
 7. Alkeni i alkini
 Ishodi učenja:
 - objasniti strukturu alkena i alkina i navesti osnovne reakcije dobivanja iz alkil- halogenida ili alkohola
 - razumijevanje reakcijskih mehanizama i prepoznavanje reaktivnih međuprodukata reakcija
 - objasniti reakciju elektrofilne adicije u odnosu na strukturu
 Kriteriji vrednovanja:
 - razlikovati nukleofile, elektrofile i slobodne radikale, razlikovati reakcije nukleofilne supstitucije, eliminacije (Zaitsevljevo i Hofmannovo pravilo), adicije (Markovnikovljevo pravilo) i primijeniti navedene reakcije na konkretnim primjerima
 - nacrtati strukturne formule produkata u reakcijama alikil-halogenida, alkohola i alkena uz definiranje stereokemije reakcija
 
 Nastavna jedinica:
 8. Nuklearna magnetska rezonancija (NMR) i spektrometrija masa
 Ishodi učenja:
 - objasniti princip nuklearne magnetske rezonancije (NMR)
 - definirati osnovne pojmove (kemijski pomak, cijepanje signala, integriranje signala, zasjenjenost protona) u NMR spektroskopiji
 - objasniti princip spektrometrije masa
 - definirati metode ionizacije organskih spojeva
 Kriteriji vrednovanja:
 - nacrtati strukturu organskog spoja prema zadanom 1H NMR spektru,
 - asignirati protone u 1H NMR spektru zadanog spoja
 - navesti fragmentiranje signala u masenom spektru za zadane spojeve
 
 Nastavna jedinica:
 9. Radikalske reakcije
 Ishodi učenja:
 - definirati radikalske reakcije i relativnu stabilnost nastalih radikala
 - objasniti višestruku supstituciju u odnosu na selektivne radikalske reakcije
 - objasniti selektivnost u radikalskim supstitucijskim reakcijama
 - definirati radikalsku polimerizaciju
 Kriteriji vrednovanja:
 - navesti primjere radikalskih reakcija uz objašnjenje mehanizma tih reakcija
 - razlikovati stabilnost strukturno različitih radikala
 - ilustrirati primjerom stereokemiju radikalskih reakcija
 - ilustrirati primjerom radikalsku polimerizaciju
 
 Nastavna jedinica:
 10. Alkoholi i eteri
 Ishodi učenja:
 - objasniti fizikalna svojstva alkohola i etera
 - poznavanje sinteze alkohola iz alkena i karbonilnih spojeva
 - poznavanje najvažnijih reakcija dobivanja etera
 - razumijevanje strategije primjene zaštitnih skupina
 - poznavanje reakcija alkohola i eter
 Kriteriji vrednovanja:
 - ilustrirati primjerima sinteze alkohola iz alkena, oksido-redukcijskom reakcijom, primjenom organometalnih spojeva
 - primijeniti odgovarajuće reagense u sintezi alkohola i etera i njihovim reakcijama
 - primijeniti odgovarajuće zaštitne skupine alkohola
 - navesti metode dobivanja etera (Williamsonovom sintezom  i dr.)
 - navesti reakcije cijepanja etera, otvaranja epoksidnog prstena uz definiranje mehanizma i stereokemije reakcije
 |